Уважаемый коллега! Спасибо Вам за интересное "повествование". Я бы предпочел обсуждать не Ваши действия в этой ситуации, а действия, а вернее "бездействие" руководства фирмы. Если я правильно понял, руководителем является один из соучредителей, причем не самый "крупный"? И меня не оставляет мысль о том, что что-то в его действиях было странным. Ну давайте порассуждаем.

Посмотрел я на это постановление и удивился. Я бы на месте оперов отказался по такому работать.
Постановление выписано не на то юридическое лицо (даже ИННа нет). Совпадает только адрес склада.
При этом продолжается вывоз товара.

Сидит этот директор дома, пьет чай, звонок в дверь - "Откройте, милиция!". Два хмурых опера, с понятыми из незнакомых людей, показывают постановление. "Вы Иванов Иван Иванович?" - "Нет, я - Сидоров Калистрат Сосипаторыч", "А где Иванов И.И.? Хотя это неважно, адрес правильно указан?" - "Да". "Прекрасно, начинаем опись принадлежащего Иванову И.И. имущества, а заодно и вывезем это имущество, чтобы Вы чего не испортили!" "Но это мое имущество! Посмотрите, у меня и документы есть, они на мое имя, здесь есть моя фотография, Иванова я не знаю, в этой квартире я прописан уже 20 лет!!!" "Гражданин, Вы что не видите адрес в постановлении - он правильный?" "Да!!!" "Ну вот, а с фамилией могли и ошибиться, у нас сейчас (1937 год) такая запарка, так что не мешайте следствию!"

Думаю, директор в этой ситуации действительно забил бы тревогу, и предпринял бы ряд действий:
а) вызвал адвоката (если есть);
б) вызвал вневедомственную охрану (тревожной кнопкой), есть есть договор с ОВО об охране квартиры (склада)
в) вызвал сотрудников милиции из ближайшего отделения;
г) вызвал Скорую помощь, т.к. от всего происходящего ему (или его близким) заплохело

Цель всего этого - зафиксировать неправомерные действия "силовиков", внести сумятицу в их действия и выиграть время.

Адвоката он все-таки вызвал - молодец! Но, очевидно, счел его единственно грамотным в такой большой (свыше 60 чел.) фирме, если посадил его составлять опись имущества. Мне кажется, что в этой ситуации опись должен составлять сотрудник охраны из бывших военных, который "тупо" (что всегда меня восхищает!) переписывает все буквы и цифры на коробках, "потому так Директор приказали, и по другому не будет, а то вы уедете - а мне еще оставаться!" Кстати, он бы мог и опечатывать коробки. Бухгалтерия подбирала документы о стоимости вывозимого имущества. Адвокат в это время бился бы над главным вопросом - обжалованием НЕЗАКОННЫХ действий. И при этом путем ПИСЬМЕННЫХ обращений, с регистрацией входящих, с приложением ксерокопий Постановления об обыске, изъятии, удостоверений сотрудников и т.д. и т.п.

В общем, грустно, как то это читать. Руководитель не должен впадать в такой ступор при приходе силовиков. Я уверен, что среди них (силовиков) подавляющее большинство порядочных людей, уважающих закон, и старающихся следовать ему. А непорядочные (но не отморозки, действующие по заказу) сотрудники отступают, видя спокойную и твердую позицию человека, уверенного в своей правоте, который начинает общение с ними с проверки документов, снятия копий, звонков в ИХ присутствии их начальству - "есть такие? посылали?". И т.д. и т.п.

Хотя я думаю, что его ступор и слепая вера в "административный" ресурс вызваны тем, что и бизнес его не совсем "чистоплотен", нет?

В общем, грустно, как то это читать. Руководитель не должен впадать в такой ступор при приходе силовиков. Я уверен, что среди них (силовиков) подавляющее большинство порядочных людей, уважающих закон, и старающихся следовать ему. А непорядочные (но не отморозки, действующие по заказу) сотрудники отступают, видя спокойную и твердую позицию человека, уверенного в своей правоте, который начинает общение с ними с проверки документов, снятия копий, звонков в ИХ присутствии их начальству - "есть такие? посылали?". И т.д. и т.п.

Не совсем так. Оставшийся один из учередителей не являлся директором. Он был замом. Причем вроде отвечал за безопасность(!)
Остальные два (фин и ген) уехали на отдых. Т.е. момент агрессии был выбран идеально. Да и очень много товара скопилось на одном складе.
По данному поводу я написал аналитическую записку шефу, ибо уж больно много странностей было, в том числе и поведении зама.
Но мое дело показать, а размышлять и принимать решения пусть руководство будет.

Хотя я думаю, что его ступор и слепая вера в "административный" ресурс вызваны тем, что и бизнес его не совсем "чистоплотен", нет?

Филосовский вопрос о чистоплотности российского бизнеса извечен. Это примерно, как про яйцо и курицу. Но то что товар был полностью чист и легально ввезен-это 100%. Возим сами.

Не совсем так. Оставшийся один из учередителей не являлся директором. Он был замом. Причем вроде отвечал за безопасность(!)

Вот это да! Это тянет, как минимум, на неполное служебное! А с учетом легальности товара - на неоказание помощи (если у него медицинское образование ), если иное - оставление в беде
Хотя, не исключено, что из-за отсутствия опыта мог растеряться и упустить время. В таких случаях действительно нужно действовать быстро, пока дело не обросло бумагами. Я бы хотел, чтобы это было именно так, потому что в противном случае ...